En la temporada 2012/2013 el club fundó el Elche C.F.S., equipo que jugó en la 3.ª División para en un plazo de 3-4 años tener a la sección en la Primera División. En estos años también salió de la sombra del FC Berna; venció a sus rivales de ciudad 3-1 y el 8 de marzo de 1903 5 a 0 en casa, esto le permitió ganar el campeonato de la Liga Central y fueron invitados a jugar en la final del campeonato suizo.